李学川擅长用针灸。但是清初至民国时期，针灸医学逐渐由兴盛逐渐走向衰退。李学川因而感慨当时轻视针灸的社会风气，认为“今医独视方药，视针灸为小技而忽诸”。所以意欲通方药、针灸两家之界限，提出针灸与方药可以左右逢源，才能使得医者在临证时能够更加全面诊治。所以，在清代嘉庆二十年（公元1815年），综合《灵枢》、《素问》、《针灸甲乙经》经穴的异同，并参考伤寒杂病方书而著成《针灸逢源》一书。

《针灸逢源》全书共六卷，卷一为《灵枢》经文，卷二为《素问》经文，两卷共摘引《内经》原文及名家注疏达百余篇，以阐述针灸要旨，作为针灸医学的理论基础；卷三为群书荟萃，撷取历代针灸专著及诸家针灸医论之精要；卷四专论经穴考正，校正铜人经穴之讹误，包括骨度、仰人伏人部位图、背胸腹部折法、同身寸法、周身骨部名目、十二经络次序、十四经穴图、十四经穴考、经外奇穴等内容；卷五列述了四十多种病症的针灸治疗取穴方法，并有各种小儿诊法和推拿法。卷六为对临床各科病证进行病因、病机分析，并附有部分汤药处方以济针术之治，即以针灸为主，辅以方药进行治疗。

 《针灸逢源》是继《医宗金鉴·刺灸心法要诀》之后又一部内容较为完备，而又具有一定特色的综合性针灸专著，与明代的同类针灸专著相比，总体内容上与《针灸大成》相类似，但编排取舍更为精审，其所摘引《内经》原文注释详明，在经穴的数目上较明代《针灸大成》为多，增加了中枢、急脉两穴，达361穴，以后人们论述经穴总数时，多以此说为凭。该书还汇集了当时新的针灸治疗经验，如“太乙神针”和刺痧法等。

  纵览该书，不但探寻了《灵枢》、《素问》等古典所述的医学源流，而且汇集了以往各家针灸医学学术思想的精华，考订了一些经穴的错误，总结了清代中期以前针灸医学的理论与实践，对后世针灸医学的发展产生了一定的影响。